其实遇到boot.ini文件非法的警告，多数是由于该文件可能存在配置错误导致的，只需要找到boot.ini文件检查错误，并修改该问题即可。
boot.ini 是操作系统启动配置文件，在电脑启动中很重要。尤其是如果有多个操作系统的话，它可以选择启动哪一个系统。如果配置文件损坏，就会提示boot.ini文件非法。但不影响系统的正常运做。修复方法也比较简单，如手工修复，也可以用系统盘或网上下载boot.ini文件修复均可。
下面介绍下简单的手动修复boot.ini文件非法的方法：
用记事本打开boot.ini配置文件后改称默认初始值：
[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /noexecute=optin /fastdetect
注意：boot.ini文件在C盘根目录，具有SHR三种属性，可以用DOS命令去掉相关属性后再修改，修改后再恢复该文件的相关属性。或者原文件丢失，手工建立后，加上这些属性，有助于保护文件。
去掉属性：attrib -s -h -r boot.ini
加上属性：attrib +s +h +r boot.ini
另外，可以在命令行状态下执行bootcfg.exe。执行bootcfg.exe /?命令以查看相关参数功能。
保存之后重新启动电脑，boot.ini文件非法的提示一般就消失了。当然也可以直接网上下载boot.ini文件，然后替换掉C盘windows目录下的boot.ini文件即可，不过手动修复也比较简单，下载替换的话，需要知道boot.ini文件在哪。